Вот что написано в GPLv2:
These requirements apply to the modified work as a whole. If identifiable sections of that work are not derived from the Program, and can be reasonably considered independent and separate works in themselves, then this License, and its terms, do not apply to those sections when you distribute them as separate works. But when you distribute the same sections as part of a whole which is a work based on the Program, the distribution of the whole must be on the terms of this License, whose permissions for other licensees extend to the entire whole, and thus to each and every part regardless of who wrote it.
Эти требования применяются к модифицированному произведению в целом. Если известные части этого произведения не были основаны на Программе и могут обоснованно считаться независимыми и самостоятельными произведениями, то эта Лицензия и её условия не распространяются на эти части, если вы распространяете их как отдельные произведения. Но когда вы распространяете эти части внутри целого, что является работой, основанной на Программе, распространение целого должно попадать под требования этой Лицензии, чьи ограничения для получателей лицензии будут распространяться на целое, и на все части независимо от того, кто их написал.
Т.е. достаточно нам не распространять с исходным кодом эти юниты и проблема исчерпана.